式内社佐渡一ノ宮は、五十猛命を祭神に陸上海上の守護神として信仰を集めています。
「延喜式」神名帳（927年）に記載されている神社を式内社と言います。
当時佐渡には九社あり、その第一の宮として古来より一ノ宮と称し格式の高い神社でした。
しかし、1470年の羽茂川の大洪水により社地、古文書等がことごとく流出した為、その由緒や縁起などは明らかではありません。
その後、現在の地に御遷座申し上げたもので1871年に国幣小社に列せられました。
現在の御本殿は1709年に、幣殿、拝殿は昭和12年の御造営によるもので、全て台湾産の檜が用いられています。